Tras la constitución de la Federación se convocó un concurso para dotarla de un logotipo, resultando ganadora la propuesta de Francisco Javier Rodríguez Ramos. Para el concurso contamos con la colaboración de la revista AstronomíA y la empresa Lunático Astronomía S.L.
El logotipo representa a la Federación con la 'f' central que forma a su derecha la silueta de un observatorio astronómico. En la parte de la izquierda refleja otro de los objetivos de la Federación: iluminar correctamente las ciudades. Esto es: hacia abajo y con luz amarilla-ámbar, permitiendo la contemplación del cielo estrellado.
El logotipo, que puede descargarse a continuación, puede ser utilizado en aquellas actividades que cuenten con la colaboración, el soporte y/o la difusión de la Federación de Asociaciones Astronómicas de España.
Se recomienda usar, siempre que sea posible, la versión a todo color con el texto completo.